股权转让个人所得税的计算是按照公平交易价格确定计税依据。当计税基础明显偏低且无正当理由时，税务机关可以采用本公告所列方法进行认定。股权转让所得应纳个人所得税税额为股权转让应纳税所得额的20%。
无正当理由计税基础是否明显偏低的判断方法如下：
（一）有下列情形之一且无正当理由的，计税基础可以被视为明显低价： 1、声明 自然人转让股权的价格低于初始投资成本或取得股权所支付的价款及相关税费； 2、自然人转让股权的价格低于公司转让的股权价格相应的净资产份额； 3、自然人申报转让的股权价格低于同一股东或者同一企业其他股东在相同或类似条件下的股权转让价格； 4、自然人申报的股权转让价格低于同行业相同或类似条件下企业的股权转让价格； 5.经主管税务机关批准认定的其他情形。
（二）本条第一款所称正当理由，是指下列情形： （一）被投资企业连续三年以上（含三年）亏损； 2、因国家政策调整而低价转让股权； 3. 将股权转让给您的配偶、父母、子女、祖父母、祖父母、孙子女、兄弟姐妹，以及直接承担抚养费的照顾者或照顾者r 对转让人的支持义务；
4.税款征收后经机关认定的其他合理情况。
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